Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC6Q7Z403 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC6Q7Z403 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC6Q7Z403 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms