Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRC3Q7RTR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC3Q7RTR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms