Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC8DQ7L1W4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC8DQ7L1W4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC8DQ7L1W4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC8DQ7L1W4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC8DQ7L1W4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8DQ7L1W4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms