Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLRC1Q6VVB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NHLRC1Q6VVB1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC1Q6VVB1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms