Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYPD4Q6UWN0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYPD4Q6UWN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD4Q6UWN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms