Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC62Q6P9F0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC62Q6P9F0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC62Q6P9F0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms