Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4F1Q66K89 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E4F1Q66K89 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E4F1Q66K89 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
E4F1Q66K89 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms