Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LYSMD4Q5XG99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LYSMD4Q5XG99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LYSMD4Q5XG99 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms