Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QL3Q5VWW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QL3Q5VWW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms