Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF220Q5VTB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF220Q5VTB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF220Q5VTB9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms