Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRTP1Q5TC63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRTP1Q5TC63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRTP1Q5TC63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRTP1Q5TC63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms