Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC183Q5T5S1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC183Q5T5S1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC183Q5T5S1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms