Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPANXN3Q5MJ09 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPANXN3Q5MJ09 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms