Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPANXN4Q5MJ08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN4Q5MJ08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN4Q5MJ08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms