Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A13Q5J8X5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A13Q5J8X5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MS4A13Q5J8X5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms