Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFT2D3Q587I9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFT2D3Q587I9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms