Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LACTB2Q53H82 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LACTB2Q53H82 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LACTB2Q53H82 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms