Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM259Q4ZIN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM259Q4ZIN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM259Q4ZIN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM259Q4ZIN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms