Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUSP28Q4G0W2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUSP28Q4G0W2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUSP28Q4G0W2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUSP28Q4G0W2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms