Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU2Q2VPK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU2Q2VPK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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