Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VMACQ2NL98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VMACQ2NL98 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VMACQ2NL98 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms