Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 TPRA1-208ENST00000483868 1720 ntTSL 530.27■■■□□ 2.441e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PLXNA3-208ENST00000495040 421 ntTSL 529.65■■■□□ 2.342e-14■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-203ENST00000393400 1831 ntTSL 1 (best)29.33■■■□□ 2.291e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.231e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 MOSPD3-207ENST00000493970 853 ntTSL 528.64■■■□□ 2.181e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.971e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 324.61■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LTBP4-206ENST00000546155 1285 ntTSL 222.22■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-210ENST00000455690 784 ntTSL 321.63■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)21.53■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 CORO7-232ENST00000576637 730 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 517.83■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-206ENST00000471461 2286 ntTSL 217.51■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LTBP4-222ENST00000598256 752 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-204ENST00000462261 1619 ntTSL 216.25■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-204ENST00000463215 627 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-203ENST00000462205 619 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-207ENST00000443220 1175 ntTSL 215.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-206ENST00000437278 862 ntTSL 515.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PCIF1-202ENST00000479348 1324 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-207ENST00000478977 580 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-205ENST00000463947 670 ntTSL 315.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-210ENST00000479024 1714 ntTSL 215.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-206ENST00000497413 618 ntTSL 214.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-213ENST00000477274 705 ntTSL 514.32□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ITGA5-211ENST00000552564 4996 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LSS-210ENST00000491729 2143 ntTSL 213.82□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 MAMDC4-205ENST00000485732 4112 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-203ENST00000441123 5380 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 512.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-206ENST00000449261 4816 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-205ENST00000452187 1269 ntTSL 511.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-201ENST00000318129 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 310.91□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-204ENST00000441730 3329 ntTSL 510.53□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LSS-208ENST00000474319 3601 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PRPF3-202ENST00000467329 2595 ntTSL 510.26□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-208ENST00000492193 546 ntTSL 310.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-206ENST00000567143 3202 nt6.43□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-203ENST00000403017 4130 ntTSL 55.88□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PRPF3-204ENST00000470824 898 ntTSL 25.63□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-9■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT213.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 CBX5-202ENST00000439541 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-205ENST00000563642 4184 ntTSL 213.6□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-9■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 514.15□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.381e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 527.55■■■□□ 21e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 523.02■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 519.59■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 317.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 514.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CLSTN3-202ENST00000331148 2288 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.473e-14■■■■■ 42.9
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