RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.16■■□□□ 1.3
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GINS3-201ENST00000318129 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.45■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.44■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.42■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 CUX2O14529 1486 aa16.42■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.42■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 IFT140Q96RY7 1462 aa16.41■□□□□ 0.22
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GINS3-201ENST00000318129 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.31■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.31■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.29■□□□□ 0.2
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GINS3-201ENST00000318129 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.26■□□□□ 0.19
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GINS3-201ENST00000318129 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.17■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.16■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.15■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
GINS3-201ENST00000318129 ADAMTS12P58397 1594 aa16.11■□□□□ 0.17
GINS3-201ENST00000318129 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.1■□□□□ 0.17
GINS3-201ENST00000318129 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-201ENST00000318129 SYNJ2O15056 1496 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-201ENST00000318129 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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