Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSME4Q14997 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME4Q14997 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME4Q14997 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PSME4Q14997 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME4Q14997 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms