Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL1Q13616 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL1Q13616 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL1Q13616 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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