Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDR1Q08345 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDR1Q08345 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
DDR1Q08345 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDR1Q08345 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDR1Q08345 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms