Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN1Q04323 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBXN1Q04323 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN1Q04323 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
UBXN1Q04323 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UBXN1Q04323 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN1Q04323 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN1Q04323 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN1Q04323 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN1Q04323 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms