Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POU5F1Q01860 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POU5F1Q01860 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POU5F1Q01860 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms