Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5Q00535 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5Q00535 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms