Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX1P78414 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX1P78414 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX1P78414 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX1P78414 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX1P78414 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX1P78414 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX1P78414 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX1P78414 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX1P78414 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX1P78414 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX1P78414 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX1P78414 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX1P78414 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX1P78414 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX1P78414 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX1P78414 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX1P78414 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX1P78414 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX1P78414 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX1P78414 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX1P78414 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX1P78414 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX1P78414 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX1P78414 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX1P78414 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX1P78414 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX1P78414 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX1P78414 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX1P78414 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX1P78414 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX1P78414 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX1P78414 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX1P78414 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX1P78414 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX1P78414 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX1P78414 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX1P78414 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX1P78414 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX1P78414 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX1P78414 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX1P78414 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX1P78414 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX1P78414 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX1P78414 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX1P78414 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX1P78414 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX1P78414 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX1P78414 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX1P78414 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX1P78414 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX1P78414 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX1P78414 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX1P78414 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX1P78414 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX1P78414 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX1P78414 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX1P78414 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX1P78414 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX1P78414 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX1P78414 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX1P78414 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX1P78414 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX1P78414 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX1P78414 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX1P78414 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX1P78414 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX1P78414 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX1P78414 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX1P78414 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX1P78414 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX1P78414 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX1P78414 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX1P78414 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms