Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2A1P68400 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A1P68400 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSNK2A1P68400 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms