Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63121 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms