Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBE2HP62256 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2HP62256 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2HP62256 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2HP62256 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms