Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VBP1P61758 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VBP1P61758 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VBP1P61758 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VBP1P61758 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VBP1P61758 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VBP1P61758 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VBP1P61758 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VBP1P61758 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VBP1P61758 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VBP1P61758 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VBP1P61758 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VBP1P61758 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VBP1P61758 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VBP1P61758 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VBP1P61758 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VBP1P61758 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VBP1P61758 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VBP1P61758 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VBP1P61758 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VBP1P61758 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VBP1P61758 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VBP1P61758 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VBP1P61758 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VBP1P61758 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VBP1P61758 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VBP1P61758 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VBP1P61758 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VBP1P61758 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VBP1P61758 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VBP1P61758 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VBP1P61758 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VBP1P61758 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VBP1P61758 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VBP1P61758 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VBP1P61758 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VBP1P61758 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VBP1P61758 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VBP1P61758 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VBP1P61758 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VBP1P61758 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VBP1P61758 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VBP1P61758 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VBP1P61758 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VBP1P61758 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VBP1P61758 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VBP1P61758 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VBP1P61758 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VBP1P61758 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VBP1P61758 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VBP1P61758 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VBP1P61758 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VBP1P61758 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VBP1P61758 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VBP1P61758 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VBP1P61758 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VBP1P61758 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VBP1P61758 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VBP1P61758 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VBP1P61758 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VBP1P61758 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VBP1P61758 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VBP1P61758 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VBP1P61758 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms