Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCE1P61221 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCE1P61221 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms