Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42P60953 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42P60953 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42P60953 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42P60953 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42P60953 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42P60953 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42P60953 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42P60953 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42P60953 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42P60953 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42P60953 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42P60953 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42P60953 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42P60953 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42P60953 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42P60953 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42P60953 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42P60953 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42P60953 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42P60953 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42P60953 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42P60953 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC42P60953 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42P60953 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42P60953 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42P60953 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42P60953 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42P60953 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42P60953 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42P60953 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42P60953 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42P60953 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42P60953 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42P60953 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42P60953 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42P60953 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42P60953 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42P60953 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42P60953 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42P60953 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42P60953 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42P60953 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42P60953 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42P60953 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42P60953 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42P60953 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42P60953 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42P60953 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42P60953 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42P60953 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42P60953 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42P60953 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42P60953 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42P60953 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42P60953 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42P60953 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42P60953 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42P60953 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42P60953 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42P60953 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42P60953 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42P60953 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42P60953 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42P60953 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42P60953 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42P60953 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42P60953 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42P60953 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42P60953 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42P60953 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42P60953 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42P60953 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42P60953 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42P60953 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42P60953 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42P60953 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42P60953 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42P60953 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms