Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTBP60709 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTBP60709 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTBP60709 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTBP60709 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTBP60709 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTBP60709 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTBP60709 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTBP60709 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTBP60709 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTBP60709 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTBP60709 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTBP60709 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTBP60709 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTBP60709 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTBP60709 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTBP60709 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTBP60709 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTBP60709 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTBP60709 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTBP60709 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTBP60709 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTBP60709 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTBP60709 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTBP60709 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTBP60709 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTBP60709 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTBP60709 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTBP60709 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTBP60709 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTBP60709 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTBP60709 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTBP60709 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTBP60709 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTBP60709 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTBP60709 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTBP60709 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTBP60709 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTBP60709 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTBP60709 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTBP60709 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTBP60709 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTBP60709 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTBP60709 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTBP60709 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTBP60709 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTBP60709 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTBP60709 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTBP60709 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTBP60709 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTBP60709 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTBP60709 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTBP60709 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTBP60709 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTBP60709 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTBP60709 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTBP60709 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTBP60709 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTBP60709 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTBP60709 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTBP60709 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTBP60709 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTBP60709 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTBP60709 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTBP60709 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTBP60709 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms