Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCBP4P57723 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCBP4P57723 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCBP4P57723 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCBP4P57723 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms