Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OXCT1P55809 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
OXCT1P55809 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms