Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELLP55199 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELLP55199 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELLP55199 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELLP55199 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELLP55199 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELLP55199 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELLP55199 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ELLP55199 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELLP55199 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELLP55199 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELLP55199 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELLP55199 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELLP55199 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELLP55199 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELLP55199 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELLP55199 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELLP55199 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELLP55199 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELLP55199 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELLP55199 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELLP55199 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELLP55199 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELLP55199 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELLP55199 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELLP55199 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELLP55199 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELLP55199 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELLP55199 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELLP55199 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELLP55199 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELLP55199 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELLP55199 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELLP55199 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELLP55199 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELLP55199 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELLP55199 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELLP55199 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELLP55199 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELLP55199 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELLP55199 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELLP55199 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELLP55199 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELLP55199 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELLP55199 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELLP55199 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELLP55199 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELLP55199 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELLP55199 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELLP55199 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ELLP55199 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELLP55199 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELLP55199 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELLP55199 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELLP55199 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELLP55199 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELLP55199 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELLP55199 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELLP55199 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELLP55199 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELLP55199 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELLP55199 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELLP55199 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms