Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX9P48436 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX9P48436 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX9P48436 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOX9P48436 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX9P48436 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX9P48436 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX9P48436 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX9P48436 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX9P48436 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX9P48436 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX9P48436 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX9P48436 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX9P48436 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX9P48436 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX9P48436 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX9P48436 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX9P48436 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX9P48436 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX9P48436 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX9P48436 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX9P48436 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX9P48436 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX9P48436 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX9P48436 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX9P48436 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX9P48436 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX9P48436 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX9P48436 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX9P48436 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX9P48436 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX9P48436 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX9P48436 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX9P48436 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX9P48436 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX9P48436 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SOX9P48436 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SOX9P48436 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX9P48436 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX9P48436 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX9P48436 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX9P48436 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX9P48436 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX9P48436 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX9P48436 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX9P48436 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX9P48436 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX9P48436 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX9P48436 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX9P48436 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX9P48436 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX9P48436 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX9P48436 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX9P48436 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX9P48436 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX9P48436 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX9P48436 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX9P48436 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX9P48436 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX9P48436 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX9P48436 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX9P48436 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX9P48436 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX9P48436 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX9P48436 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX9P48436 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX9P48436 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX9P48436 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX9P48436 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX9P48436 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX9P48436 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX9P48436 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX9P48436 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX9P48436 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX9P48436 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX9P48436 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX9P48436 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX9P48436 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX9P48436 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX9P48436 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX9P48436 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms