Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ME1P48163 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ME1P48163 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ME1P48163 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ME1P48163 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ME1P48163 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ME1P48163 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ME1P48163 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ME1P48163 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ME1P48163 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ME1P48163 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ME1P48163 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ME1P48163 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ME1P48163 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ME1P48163 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ME1P48163 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ME1P48163 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ME1P48163 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ME1P48163 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ME1P48163 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ME1P48163 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ME1P48163 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ME1P48163 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ME1P48163 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ME1P48163 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ME1P48163 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ME1P48163 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ME1P48163 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ME1P48163 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ME1P48163 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ME1P48163 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ME1P48163 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ME1P48163 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ME1P48163 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ME1P48163 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ME1P48163 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ME1P48163 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ME1P48163 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ME1P48163 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ME1P48163 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ME1P48163 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ME1P48163 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ME1P48163 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ME1P48163 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ME1P48163 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ME1P48163 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ME1P48163 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ME1P48163 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ME1P48163 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ME1P48163 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ME1P48163 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ME1P48163 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ME1P48163 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ME1P48163 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ME1P48163 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ME1P48163 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ME1P48163 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ME1P48163 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ME1P48163 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ME1P48163 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ME1P48163 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ME1P48163 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ME1P48163 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ME1P48163 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ME1P48163 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ME1P48163 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ME1P48163 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ME1P48163 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ME1P48163 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ME1P48163 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ME1P48163 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ME1P48163 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ME1P48163 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ME1P48163 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ME1P48163 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ME1P48163 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ME1P48163 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ME1P48163 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ME1P48163 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ME1P48163 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ME1P48163 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ME1P48163 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ME1P48163 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ME1P48163 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ME1P48163 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ME1P48163 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms