Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN7P41732 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN7P41732 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms