Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX19P40855 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX19P40855 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX19P40855 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX19P40855 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX19P40855 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX19P40855 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX19P40855 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX19P40855 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX19P40855 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX19P40855 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX19P40855 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX19P40855 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX19P40855 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX19P40855 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX19P40855 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX19P40855 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX19P40855 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX19P40855 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX19P40855 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX19P40855 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX19P40855 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX19P40855 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX19P40855 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX19P40855 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX19P40855 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX19P40855 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX19P40855 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX19P40855 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX19P40855 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX19P40855 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX19P40855 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX19P40855 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX19P40855 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX19P40855 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX19P40855 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX19P40855 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX19P40855 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX19P40855 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX19P40855 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX19P40855 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX19P40855 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX19P40855 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX19P40855 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX19P40855 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX19P40855 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX19P40855 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX19P40855 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX19P40855 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX19P40855 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX19P40855 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX19P40855 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX19P40855 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX19P40855 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX19P40855 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX19P40855 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX19P40855 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX19P40855 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX19P40855 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX19P40855 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX19P40855 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX19P40855 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX19P40855 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX19P40855 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX19P40855 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX19P40855 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX19P40855 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX19P40855 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX19P40855 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX19P40855 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX19P40855 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX19P40855 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX19P40855 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX19P40855 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX19P40855 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX19P40855 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX19P40855 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms