Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP6P35125 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP6P35125 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP6P35125 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP6P35125 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP6P35125 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP6P35125 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP6P35125 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP6P35125 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP6P35125 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP6P35125 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP6P35125 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP6P35125 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP6P35125 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP6P35125 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
USP6P35125 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP6P35125 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP6P35125 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP6P35125 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP6P35125 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP6P35125 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP6P35125 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP6P35125 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP6P35125 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP6P35125 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP6P35125 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP6P35125 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
USP6P35125 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP6P35125 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP6P35125 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP6P35125 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP6P35125 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
USP6P35125 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
USP6P35125 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
USP6P35125 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP6P35125 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP6P35125 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP6P35125 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP6P35125 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP6P35125 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP6P35125 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP6P35125 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP6P35125 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP6P35125 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP6P35125 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP6P35125 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP6P35125 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP6P35125 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP6P35125 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP6P35125 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP6P35125 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP6P35125 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP6P35125 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP6P35125 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP6P35125 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP6P35125 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP6P35125 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP6P35125 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP6P35125 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP6P35125 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP6P35125 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP6P35125 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
USP6P35125 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP6P35125 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP6P35125 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP6P35125 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP6P35125 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP6P35125 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP6P35125 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP6P35125 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP6P35125 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
USP6P35125 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
USP6P35125 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
USP6P35125 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
USP6P35125 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP6P35125 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP6P35125 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP6P35125 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP6P35125 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP6P35125 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms