Protein–RNA interactions for Protein: P23946

CMA1, Chymase, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMA1P23946 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CMA1P23946 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CMA1P23946 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CMA1P23946 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CMA1P23946 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CMA1P23946 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CMA1P23946 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CMA1P23946 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CMA1P23946 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CMA1P23946 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CMA1P23946 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMA1P23946 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMA1P23946 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMA1P23946 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMA1P23946 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMA1P23946 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMA1P23946 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CMA1P23946 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CMA1P23946 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CMA1P23946 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CMA1P23946 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CMA1P23946 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CMA1P23946 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CMA1P23946 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CMA1P23946 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CMA1P23946 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CMA1P23946 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CMA1P23946 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CMA1P23946 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CMA1P23946 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CMA1P23946 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CMA1P23946 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CMA1P23946 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CMA1P23946 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CMA1P23946 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CMA1P23946 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CMA1P23946 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CMA1P23946 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CMA1P23946 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CMA1P23946 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CMA1P23946 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CMA1P23946 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CMA1P23946 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CMA1P23946 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CMA1P23946 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CMA1P23946 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CMA1P23946 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CMA1P23946 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CMA1P23946 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CMA1P23946 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CMA1P23946 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CMA1P23946 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CMA1P23946 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CMA1P23946 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CMA1P23946 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CMA1P23946 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CMA1P23946 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CMA1P23946 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CMA1P23946 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CMA1P23946 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CMA1P23946 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CMA1P23946 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CMA1P23946 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CMA1P23946 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CMA1P23946 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CMA1P23946 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CMA1P23946 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CMA1P23946 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CMA1P23946 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CMA1P23946 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CMA1P23946 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CMA1P23946 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CMA1P23946 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CMA1P23946 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CMA1P23946 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CMA1P23946 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CMA1P23946 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CMA1P23946 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CMA1P23946 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CMA1P23946 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CMA1P23946 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CMA1P23946 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CMA1P23946 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CMA1P23946 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CMA1P23946 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CMA1P23946 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CMA1P23946 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CMA1P23946 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms