Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFYAP23511 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFYAP23511 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFYAP23511 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFYAP23511 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFYAP23511 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFYAP23511 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFYAP23511 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFYAP23511 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFYAP23511 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFYAP23511 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFYAP23511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFYAP23511 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFYAP23511 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFYAP23511 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFYAP23511 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFYAP23511 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFYAP23511 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFYAP23511 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFYAP23511 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFYAP23511 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFYAP23511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFYAP23511 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFYAP23511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFYAP23511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFYAP23511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFYAP23511 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFYAP23511 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFYAP23511 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFYAP23511 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFYAP23511 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFYAP23511 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFYAP23511 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFYAP23511 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFYAP23511 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFYAP23511 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFYAP23511 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFYAP23511 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFYAP23511 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFYAP23511 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFYAP23511 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFYAP23511 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFYAP23511 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFYAP23511 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFYAP23511 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFYAP23511 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFYAP23511 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFYAP23511 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFYAP23511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFYAP23511 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFYAP23511 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFYAP23511 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFYAP23511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFYAP23511 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFYAP23511 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFYAP23511 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFYAP23511 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFYAP23511 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFYAP23511 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFYAP23511 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFYAP23511 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFYAP23511 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFYAP23511 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFYAP23511 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFYAP23511 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFYAP23511 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFYAP23511 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFYAP23511 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFYAP23511 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFYAP23511 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms