Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ACO1P21399 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACO1P21399 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACO1P21399 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACO1P21399 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACO1P21399 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACO1P21399 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACO1P21399 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACO1P21399 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ACO1P21399 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ACO1P21399 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACO1P21399 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACO1P21399 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACO1P21399 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACO1P21399 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ACO1P21399 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACO1P21399 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACO1P21399 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACO1P21399 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACO1P21399 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACO1P21399 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACO1P21399 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACO1P21399 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACO1P21399 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACO1P21399 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACO1P21399 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACO1P21399 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACO1P21399 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACO1P21399 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACO1P21399 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACO1P21399 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACO1P21399 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACO1P21399 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACO1P21399 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ACO1P21399 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACO1P21399 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACO1P21399 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACO1P21399 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACO1P21399 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACO1P21399 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACO1P21399 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACO1P21399 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACO1P21399 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACO1P21399 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACO1P21399 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACO1P21399 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACO1P21399 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACO1P21399 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACO1P21399 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACO1P21399 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACO1P21399 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACO1P21399 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACO1P21399 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACO1P21399 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACO1P21399 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACO1P21399 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACO1P21399 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACO1P21399 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACO1P21399 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACO1P21399 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACO1P21399 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACO1P21399 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACO1P21399 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACO1P21399 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACO1P21399 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACO1P21399 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACO1P21399 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACO1P21399 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACO1P21399 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACO1P21399 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACO1P21399 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACO1P21399 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACO1P21399 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ACO1P21399 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACO1P21399 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACO1P21399 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACO1P21399 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACO1P21399 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACO1P21399 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACO1P21399 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACO1P21399 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACO1P21399 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACO1P21399 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACO1P21399 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACO1P21399 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACO1P21399 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACO1P21399 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACO1P21399 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms