Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3BP20337 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3BP20337 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3BP20337 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms