Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GNB3P16520 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNB3P16520 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNB3P16520 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNB3P16520 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB3P16520 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB3P16520 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB3P16520 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB3P16520 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB3P16520 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB3P16520 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB3P16520 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB3P16520 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB3P16520 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB3P16520 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB3P16520 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB3P16520 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB3P16520 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB3P16520 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB3P16520 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB3P16520 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GNB3P16520 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNB3P16520 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNB3P16520 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNB3P16520 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNB3P16520 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNB3P16520 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNB3P16520 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNB3P16520 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNB3P16520 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNB3P16520 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB3P16520 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNB3P16520 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB3P16520 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB3P16520 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB3P16520 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB3P16520 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GNB3P16520 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNB3P16520 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GNB3P16520 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNB3P16520 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GNB3P16520 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNB3P16520 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GNB3P16520 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GNB3P16520 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB3P16520 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB3P16520 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB3P16520 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB3P16520 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB3P16520 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB3P16520 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB3P16520 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB3P16520 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB3P16520 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB3P16520 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB3P16520 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB3P16520 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB3P16520 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB3P16520 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB3P16520 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB3P16520 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB3P16520 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB3P16520 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB3P16520 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNB3P16520 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNB3P16520 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNB3P16520 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 423.8 ms